home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00509 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.9 KB  |  42 lines
  1. ******************************
  2. * LIF / OSM family signature *
  3. ******************************
  4.  
  5. On the  basis  of  functional and structural similarities, the following small
  6. cytokines can be classified into a single family [1,2]:
  7.  
  8.  - Leukemia inhibitory factor (LIF) (also known as differentiation-stimulating
  9.    factor). LIF is a mammalian growth factor that controls the differentiation
  10.    and proliferation of   hematopoietic  cells  as  well  as those of  several
  11.    other cellular lineages.
  12.  - Oncostatin (OSM),  a growth  regulator  produced  by a  number of mammalian
  13.    cells lines.  OSM  is capable of inhibiting  the replication of a number of
  14.    tumor cells.   It  may  play  a  role  in  the  regulation  and  growth  of
  15.    hematopoietic cells.
  16.  
  17. As a signature pattern for these cytokines, we selected a  conserved region in
  18. their C-terminal section.  This  region  is  centered on a  conserved cysteine
  19. which  has  been  shown [3],  in  OSM, to be involved in a disulfide bond. The
  20. C-terminal part  of  this  region  is  very  hydrophobic  and  is  known to be
  21. essential to the biological activity of OSM.
  22.  
  23. -Consensus pattern: G-x(13)-[DE]-x-F-Q-[KR]-K-x(2)-G-C-x(2)-L-x(2)-Y-x(3)-
  24.                     [LIVM]-x(2)-[LIVM]-x(3)-F
  25.                     [C is involved in a disulfide bond]
  26. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  27. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  28.  
  29. -Note: it has been said [2]  that  LIF and OSM can  be  included  in  the IL-6
  30.  family of cytokines (see the relevant entry), but  while  all these cytokines
  31.  seem to be structurally related,  the sequence similarity  is not high enough
  32.  to allow the use of a single consensus pattern.
  33.  
  34. -Last update: June 1992 / Text revised.
  35.  
  36. [ 1] Hilton D.J.
  37.      Trends Biochem. Sci. 17:72-76(1992).
  38. [ 2] Rose T.M., Bruce A.G.
  39.      Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88:8641-8645(1991).
  40. [ 3] Kallestad J.C., Shoyab M., Linsley P.S.
  41.      J. Biol. Chem. 266:8940-8945(1991).
  42.